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新基因测序方法更精确分析单细胞
[2012/9/3]
受限于现有技术的发展,对于单细胞水平的基因特性分析是生物学家和基因学家的长期梦想。近日,来自瑞典和美国的研究团队发明一种被称为“智能测序(SMART-SEQ)”基因测序方法用于辅助科学家对临床相关的单细胞进行更精确分析,这对于研究肿瘤发展的复杂进程和治致病机理具有重要意义。
此前的研究显示,单基因能够通过对原始部分进行不同的剪切和粘贴改变其结构,形成同类蛋白质的不同表现形式。这种被称为“拼接(splicing)”的现象表明来自相同组织的细胞不一定同质。本项研究则开发出一种将单个细胞的基因表达进行完全解析,通过显示活跃的细胞,有可能精确描述来自相同组织的单个细胞基因表达的不同之处。
这一技术可有多种应用,如可研究单个患者肿瘤的细胞分型。研究人员对于多发性恶性黑色素瘤患者的血液系统肿瘤细胞进行研究。一旦在常规血检中发现肿瘤细胞后,就用“智能测序(SMART-SEQ)”方法分析其基因表达。通过这种方法证明,癌细胞已经激活对维持其能力至关重要的膜蛋白,以使癌细胞能够逃避人体的监控系统,在血液或淋巴中传播。
该项目是由欧洲研究理事会出资支持的单细胞基因学研究项目支持,将持续到2015年,主要目标是更好地了解多能干细胞的体内分化期间的基因表达调控,具有重要的生物学和医学影响。虽然目前该研究仅得到初步结果,但至少表明有可能针对单个临床诊断相关的细胞进行分析,使癌症研究人员能够对于细胞进行系统分析,为未来开发出更好的诊断和治疗方法铺平道路。
此前的研究显示,单基因能够通过对原始部分进行不同的剪切和粘贴改变其结构,形成同类蛋白质的不同表现形式。这种被称为“拼接(splicing)”的现象表明来自相同组织的细胞不一定同质。本项研究则开发出一种将单个细胞的基因表达进行完全解析,通过显示活跃的细胞,有可能精确描述来自相同组织的单个细胞基因表达的不同之处。
这一技术可有多种应用,如可研究单个患者肿瘤的细胞分型。研究人员对于多发性恶性黑色素瘤患者的血液系统肿瘤细胞进行研究。一旦在常规血检中发现肿瘤细胞后,就用“智能测序(SMART-SEQ)”方法分析其基因表达。通过这种方法证明,癌细胞已经激活对维持其能力至关重要的膜蛋白,以使癌细胞能够逃避人体的监控系统,在血液或淋巴中传播。
该项目是由欧洲研究理事会出资支持的单细胞基因学研究项目支持,将持续到2015年,主要目标是更好地了解多能干细胞的体内分化期间的基因表达调控,具有重要的生物学和医学影响。虽然目前该研究仅得到初步结果,但至少表明有可能针对单个临床诊断相关的细胞进行分析,使癌症研究人员能够对于细胞进行系统分析,为未来开发出更好的诊断和治疗方法铺平道路。
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