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典型PCR操作程序与优化方法
[2015/9/14]
一、试剂
(1)引物根据待扩增DNA不同,引物亦不同。
(2)耐热DNA聚合酶:此酶是从耐热细菌中分离出来的,能耐受高温(93~100℃)。
(3)10x PCR缓冲液:500mm01/LKCl; 100mmol/LTris-HCl(pH8.4,20c),150mmol/LMgCl2,lmg/m1明胶。
(4)5mmo1/LdNTP贮备液:将dATP,dCTP,dGTPT和dTTP钠盐各100mg合并,加3m1灭菌去离子水溶解,用NaOH调pH至中性,分装每份300v1,-20℃保存,dNTP浓度最好用uv吸收法精确测定。
(5)标本处理试剂:不同标本所需试剂不同,根据具体情况而定。
二、操作程序
利用PCR扩增的操作程序基本相同,只是根据引物与靶序列的不同,选择不同的反应体系与循环参数,基本的操作是将PCR必需反应成分加入一微量离心管中,然后置于一定的循环参数条件下进行循环扩增。每个实验室或每个人都有不同的操作习惯,但需遵守一定的操作规范。推荐下述操作程序,因这样操作可最大程度地增加反应的成功率。
(1)向一微量离心管中依次加入:
ddH2O补至终体积(终体积50~100ul)
10xPCR缓冲液1/10体积
dNTP各200umol/L
引物各1umol/L
DNA模板
混匀后,离心15s使反应成分集于管底。
(2)加石蜡油50~100ul于反应液表面以防蒸发。置反应管于97c变性7min(染色体DNA)或5min(质粒DNA)。
(3)冷至延伸温度时,加入1~5UTaqDNA聚合酶,在此温度作用1min。
(4)于变性温度下使模板DNA变性适当时间。
(5)在复性温度下使引物与模板杂交一定时间。
(6)在延伸温度下使复性的引物延伸合适的时间。
(7)重复(4)~(6)步25~30次。每次即为一个PCR循环。
(8)微量琼脂德凝胶电泳检查扩增产物。